Malcesine è situata nella parte nord della riva orientale del Lago di Garda.

Percorrendo la A4 è necessario uscire a Peschiera del Garda.

Proseguendo lungo la Gardesana Orientale (SS 249) , in direzione nord verso Riva del Garda, l'ultima cittadina prima di Torbole è Malcesine.

E' possibile anche, se si proviene da Venezia, peroccorrere l'autostrada del Brennero fino ad Affi e successivamente imboccare qui la Gardesana Orientale.